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第一章 绪论1

第一节 病毒学的历史与进化1

一、病毒学前历史1

二、病毒的发现1

三、病毒学研究方法的发展2

四、分子病毒学的发展4

五、病毒学发展史上的重大事件4

第二节 病毒的定义与分类6

一、病毒的定义6

二、病毒的进化7

三、病毒的分类8

第二章 病毒的组成及基因组17

第一节 病毒的组成结构与功能17

一、病毒衣壳的对称及吸附17

二、病毒的螺旋状衣壳18

三、二十面体（等轴）衣壳19

四、复合体病毒衣壳20

五、包被病毒20

六、病毒的蛋白质20

第二节 病毒的基因组及结构23

一、病毒基因组的分类23

二、大DNA病毒23

三、小DNA病毒24

四、RNA病毒（非节段基因组）25

五、RNA病毒（节段基因组）25

第三章 病毒吸附宿主细胞及其内化过程29

第一节 细胞表面的结构特征29

一、细胞外基质29

二、细胞膜及膜蛋白29

第二节 病毒与细胞受体的相互作用30

一、各种不同病毒的受体30

二、病毒对受体的吸附31

三、细胞对病毒的内吞作用32

第三节 病毒侵入宿主细胞的分子机制33

一、病毒通过与细胞膜的融合侵入宿主细胞33

二、病毒通过内吞作用侵入宿主细胞35

三、无包膜病毒侵入宿主细胞的过程36

四、参与病毒脱壳的分子37

第四节 病毒基因组进入宿主细胞核的分子机制38

一、介导蛋白质入核的细胞通路38

二、不同病毒基因组的入核机制39

第四章 DNA病毒基因组的复制42

第一节 DNA病毒基因组复制的特点42

一、半保留复制42

二、复制原点与复制方向42

三、连续复制与不连续复制43

四、复制酶及附属蛋白43

五、复制触发机制45

第二节 病毒DNA复制的多样性46

一、病毒DNA复制多样性的产生46

二、病毒DNA复制方式47

三、双链闭环DNA病毒的复制47

四、双链线性DNA病毒的复制51

五、单链线性DNA病毒的复制54

第三节 宿主细胞对病毒DNA复制的影响55

一、病毒基因产物诱导宿主细胞复制蛋白的合成55

二、Rb基因与DNA病毒基因组的复制56

三、p53基因与DNA病毒复制56

四、大量病毒复制蛋白的合成56

五、病毒DNA的限制性复制57

六、病毒DNA复制的亚细胞器分布及特点58

第四节 病毒DNA的遗传与变异58

一、DNA病毒遗传学特征58

二、病毒基因组的重组58

三、缺陷病毒59

第五节 DNA病毒与宿主细胞的DNA损伤反应60

一、DNA病毒复制与DNA损伤反应通路60

二、DDR在抑制病毒诱导的细胞增殖中的作用61

三、DDR在促进病毒DNA复制中的作用63

四、DNA病毒复制与染色体不稳定性64

第六节 DNA病毒基因组复制的调控64

第七节 展望65

第五章 RNA病毒的基因组复制68

第一节 正链RNA病毒基因组复制68

一、正链RNA病毒基因组结构特征69

二、正链RNA病毒基因组复制特征70

三、宿主因子对正链RNA病毒基因组复制的调控及影响73

第二节 负链RNA病毒基因组的复制76

一、负链RNA病毒基因组结构特征77

二、负链RNA病毒基因组复制特征77

三、负链RNA病毒基因组变异78

第三节 双链RNA病毒基因组的复制80

一、双链RNA病毒及其基因组结构80

二、双链RNA病毒基因组的复制与调控82

三、逆转录病毒基因组的复制与调控84

第四节 展望89

第六章 病毒基因表达调控91

第一节 病毒基因表达调控原理91

一、原核细胞的基因调控91

二、λ噬菌体基因的表达调控92

三、真核基因的表达调控93

第二节 病毒基因的转录调控93

一、转录的起始和转录复合体的建立93

二、病毒蛋白在转录中的作用94

第三节 病毒基因转录后水平的调控96

一、转录产物的加工96

二、转录产物的输出98

三、病毒蛋白在转录后的调控作用99

第四节 病毒基因的翻译及翻译后调控101

一、多聚蛋白的合成和加工处理101

二、渗漏扫描机制101

三、翻译重新起始102

四、核糖体可读框移位102

五、翻译终止的抑制103

第五节 各类病毒基因的表达调控103

一、双链DNA病毒103

二、单链DNA病毒104

三、双链RNA病毒104

四、正链RNA病毒105

五、负链RNA病毒105

六、带有DNA中间体的正链RNA病毒106

七、带有RNA中间体的双链DNA病毒106

第七章 病毒粒子的装配、成熟和释放110

第一节 病毒核衣壳的装配110

一、DNA病毒核衣壳的装配110

二、RNA病毒核衣壳的装配114

第二节 子代病毒粒子的成熟117

一、病毒蛋白的水解加工117

二、其他成熟反应119

第三节 病毒包膜的获得119

一、从核膜上获取包膜119

二、从细胞质内膜上获取包膜119

三、从细胞膜上获取包膜119

第四节 病毒粒子的释放121

一、无包膜病毒的释放121

二、包膜病毒的释放121

三、病毒在细胞之间的扩散122

第八章 病毒感染的特点125

第一节 病毒感染的类型125

一、急性感染125

二、持续性感染126

三、其他类型的感染127

第二节 病毒在宿主体内的播散127

一、病毒侵入机体的途径128

二、病毒在机体内的播散128

三、病毒的组织亲嗜性130

四、病毒的排出和传播131

第三节 病毒感染对宿主细胞造成的损伤131

一、杀细胞效应132

二、非杀细胞效应132

三、免疫病理损伤133

第四节 病毒感染与细胞凋亡135

一、细胞凋亡概述135

二、病毒对细胞凋亡的抑制137

三、病毒对细胞凋亡的诱导140

第五节 宿主对病毒性疾病的易感性142

一、遗传因素142

二、非遗传因素143

第九章 病毒致瘤的分子机制146

第一节 具有致瘤作用的病毒146

一、致瘤性RNA病毒146

二、致瘤性DNA病毒148

第二节 病毒致瘤的细胞信号转导机制150

一、EB病毒感染的细胞信号转导机制150

二、丙型肝炎病毒感染的细胞信号转导机制155

第三节 病毒编码产物调控细胞周期的机制157

一、细胞周期调节网络157

二、病毒编码产物对细胞周期的调控158

第四节 病毒编码产物调控细胞凋亡的机制161

一、细胞凋亡和胱天蛋白酶161

二、病毒编码产物对细胞凋亡的抑制161

三、病毒编码产物对细胞凋亡的诱导163

第十章 病毒免疫167

第一节 抗病毒免疫的细胞和分子机制167

一、病毒感染的免疫学特征167

二、抗病毒固有免疫反应168

三、适应性抗病毒免疫反应172

四、抗病毒免疫记忆176

五、抗病毒免疫调节177

第二节 病毒免疫逃逸的机制178

一、限制病毒基因的表达178

二、感染免疫特赦部位178

三、逃避抗体和T细胞的识别178

四、抑制细胞表面免疫分子的表达179

五、阻碍抗原处理和提呈179

六、干扰细胞因子和趋化因子的作用179

七、免疫耐受和免疫抑制180

八、病毒抗原变异180

第三节 病毒免疫研究的展望180

第十一章 病毒性疾病的预防和治疗182

第一节 病毒疫苗183

一、活疫苗184

二、灭活疫苗187

三、佐剂188

四、亚单位疫苗188

五、DNA疫苗189

六、多肽疫苗190

第二节 病毒性疾病的化学治疗190

一、抗病毒化疗药物的基本研发策略192

二、核苷类似物193

三、新型抗病毒化疗药物194

四、抗病毒化疗药物的抗性196

五、组合疗法197

第三节 病毒性疾病的免疫治疗198

一、细胞疗法198

二、细胞因子疗法199

三、抗体疗法200

第四节 病毒性疾病的基因治疗200

一、RNA疗法201

二、抗病毒的基因治疗203

第十二章 病毒载体与基因治疗205

第一节 概述205

一、病毒载体的发展简史206

二、病毒载体的基本特征206

第二节 逆转录病毒载体207

一、逆转录病毒的生物学特性207

二、逆转录病毒载体的构建207

三、逆转录病毒载体及其临床应用207

第三节 DNA病毒载体213

一、腺相关病毒载体213

二、腺病毒载体220

三、疱疹病毒载体222

四、痘病毒载体226

第四节 其他病毒载体228

第五节 嵌合病毒载体229

一、腺病毒嵌合载体229

二、腺相关病毒嵌合载体229

三、单纯疱疹病毒嵌合载体230

第十三章 人类免疫缺陷病毒232

第一节 人类免疫缺陷病毒的发现、分类与起源232

第二节 HIV的特征233

一、HIV的形态结构233

二、HIV的基因组233

三、HIV编码的蛋白质234

第三节 HIV的生活周期239

一、病毒颗粒与细胞表面的受体结合239

二、逆转录、入核和整合240

三、RNA的转录、剪接和进入胞质241

四、结构蛋白质的表达、RNA包装及病毒颗粒的装配和成熟242

五、HIV感染的潜伏状态243

第四节 HIV的传播途径243

一、血液传播243

二、性接触传播244

三、母婴传播244

第五节 HIV的致病机制244

一、HIV病毒的细胞毒性244

二、HIV对免疫系统的影响245

三、对其他系统和器官的影响246

四、HIV与癌246

第六节 HIV感染所诱发的免疫反应247

一、体液免疫反应247

二、细胞免疫反应247

三、其他天然抗HIV病毒复制的体液因子248

第七节 HIV感染的病程和体内复制的动力学248

一、病程演变248

二、HIV在体内复制的动力学249

第八节 HIV的治疗与预防250

一、抗病毒的药物治疗250

二、高效抗逆转录病毒治疗条件下残余HIV复制的治疗和免疫重建251

三、疫苗的发展252

第九节 展望253

第十四章 流行性感冒病毒255

第一节 流感病毒的发现和分类255

一、流感病毒的发现255

二、流感病毒的分类255

第二节 流感病毒的特征256

一、流感病毒的形态结构256

二、流感病毒的基因组256

三、流感病毒编码蛋白功能256

第三节 流感病毒的生活周期259

一、病毒的吸附、侵入和脱壳259

二、病毒基因组的复制和转录260

三、病毒蛋白的合成260

四、病毒粒子的装配260

五、病毒的出芽和释放260

第四节 流感病毒的致病机制260

一、人群免疫力与致病机制261

二、病毒蛋白与致病机制261

三、宿主因子与致病机制262

四、其他与致病力相关的因素262

第五节 21世纪A型流感病毒的流行262

一、人类季节性流感病毒的分子流行病学262

二、2004年H5N1禽流感病毒263

三、2009年H1N1流感病毒263

四、2013年H7N9禽流感病毒263

第六节 展望264

第十五章 汉坦病毒266

第一节 汉坦病毒的命名和分类266

一、汉坦病毒的命名266

二、汉坦病毒的型别266

第二节 汉坦病毒的一般生物学和理化特性267

一、汉坦病毒的传代培养267

二、汉坦病毒的形态结构268

三、汉坦病毒的毒力和致病性268

四、汉坦病毒的一般理化特性和抵抗力269

第三节 汉坦病毒的基因组270

一、S基因270

二、M基因270

三、L基因271

第四节 汉坦病毒的蛋白271

一、核衣壳蛋白271

二、糖蛋白Gn和Gc273

三、RNA聚合酶274

第五节 汉坦病毒的复制274

一、汉坦病毒的受体274

二、汉坦病毒基因的复制和转录276

三、汉坦病毒蛋白的转运和毒粒的装配277

第六节 汉坦病毒的进化与变异278

一、不同动物宿主之间的汉坦病毒的差异278

二、不同地域汉坦病毒之间的差异性278

三、时间对汉坦病毒同源性的影响279

四、汉坦病毒基因的重配279

五、汉坦病毒变异对毒力的影响279

第十六章 轮状病毒282

第一节 轮状病毒的性状282

一、分类282

二、病毒颗粒282

三、理化特性283

第二节 病毒基因组283

第三节 病毒蛋白284

一、结构蛋白284

二、非结构蛋白285

第四节 轮状病毒复制285

一、吸附、穿入及脱衣壳286

二、复制与转录286

三、装配286

四、病毒释放286

第五节 致病性287

一、流行病学287

二、发病机制287

三、临床表现及实验室检查288

四、诊断与治疗289

五、预防289

第十七章 肝炎病毒292

第一节 甲型肝炎病毒292

一、概述292

二、一般性状及生物学特征292

三、基因组结构、功能及编码蛋白293

四、病毒复制与胞内增殖293

五、感染宿主与实验动物模型294

六、发病机制294

七、展望295

第二节 乙型肝炎病毒及丁型肝炎病毒295

一、嗜肝DNA病毒概述295

二、乙型肝炎病毒基因组结构及编码蛋白295

三、病毒复制与感染298

四、乙型肝炎病毒基因变异299

五、发病机制与免疫应答301

六、慢性乙型肝炎的抗病毒治疗307

七、丁型肝炎病毒309

第三节 丙型肝炎病毒310

一、概述310

二、一般性状及理化性质310

三、基因结构及编码蛋白310

四、丙型肝炎病毒基因组序列变异311

五、发病机制及免疫应答312

第四节 戊型肝炎病毒313

一、概述313

二、病毒的理化特性313

三、戊型肝炎病毒的基因组结构及编码蛋白314

四、实验动物与细胞培养314

五、戊型肝炎疫苗315

第十八章 腺病毒320

第一节 腺病毒的结构与分类320

一、腺病毒的分类320

二、腺病毒的毒粒结构322

三、腺病毒的基因组构成322

第二节 腺病毒基因组的转录323

一、早期转录及早期蛋白324

二、晚期转录及晚期蛋白325

第三节 腺病毒的复制周期325

一、吸附和内化325

二、早期基因激活326

三、宿主细胞激活327

四、凋亡的抑制328

五、病毒DNA复制328

六、病毒晚期基因表达的激活328

七、病毒装配和释放329

第四节 腺病毒与宿主的关系330

一、人类腺病毒感染的宿主330

二、免疫逃逸330

三、肿瘤发生330

四、腺病毒感染的分子病理331

第五节 腺病毒的应用332

一、腺病毒载体的研究状况332

二、复制缺陷型重组腺病毒载体332

三、复制型重组腺病毒载体333

四、靶向性重组腺病毒载体333

第十九章 人乳头瘤病毒338

第一节 人乳头瘤病毒的基因结构和功能338

一、E6蛋白的结构与功能338

二、E7蛋白的结构与功能339

三、E5蛋白的结构与功能340

四、E1、E2、E4、L1、L2蛋白的结构与功能341

五、人乳头瘤病毒非编码区的结构与功能342

第二节 人乳头瘤病毒的自然生活史及相关疾病342

一、人乳头瘤病毒的流行病学342

二、人乳头瘤病毒传播途径及自然生活史342

三、人乳头瘤病毒相关性疾病343

四、人乳头瘤病毒DNA检测345

第三节 人乳头瘤病毒变异与宫颈癌345

一、人乳头瘤病毒型内序列变异346

二、人乳头瘤病毒基因序列变异的功能意义346

三、人乳头瘤病毒基因变异与宫颈癌347

四、人乳头瘤病毒基因变异与宿主遗传学因素347

第四节 人乳头瘤病毒疫苗348

一、机体对人乳头瘤病毒感染的免疫反应348

二、人乳头瘤病毒免疫逃逸机制349

三、人乳头瘤病毒预防性疫苗研究352

四、人乳头瘤病毒疫苗存在的问题和未来疫苗研发的方向353

第二十章 单纯疱疹病毒、巨细胞病毒和EB病毒359

第一节 单纯疱疹病毒359

一、病毒的基本特征359

二、病毒复制361

三、病毒感染与致病机制363

第二节 巨细胞病毒365

一、病毒的基本特征365

二、病毒复制367

三、病毒的感染与致病机制369

第三节 EB病毒371

一、病毒结构371

二、EB病毒的感染机制372

三、健康人对EB病毒感染的反应376

四、免疫抑制个体对EB病毒感染的反应379

第二十一章 朊病毒382

第一节 朊病毒病的种类382

一、动物朊病毒病382

二、人类朊病毒病384

三、人类朊病毒病的临床及病理学特征385

第二节 朊病毒病的感染因子386

一、感染途径及致病过程387

二、感染因子的特征387

三、朊病毒学说388

第三节 宿主基因和种属屏障作用389

一、宿主基因389

二、人PRNP基因129位密码子的多态性390

三、种属屏障现象391

第四节 PrPC和PrPSc的生物学特征392

一、正常PrPC蛋白392

二、异常PrPSc蛋白394

第五节 PrPC-PrPSc的构象转换和致病机制395

一、蛋白分子结构及相互作用395

二、PrPSc形成的模型396

三、PrPSc形成过程中的分子伴侣396

四、人工合成朊病毒397

五、朊病毒病的致病机制397

第六节 朊病毒病的实验室诊断、处理原则398

一、实验室诊断原则398

二、朊病毒病患者的日常处理原则399

三、实验室安全原则400

第二十二章 SARS冠状病毒402

第一节 SARS暴发流行的思考与启示402

一、暴发流行402

二、思考与启示403

第二节 SARS冠状病毒的发现及其思考403

第三节 SARS-CoV在冠状病毒属中的分类404

第四节 SARS冠状病毒的生物学特征405

一、SARS冠状病毒的形态结构405

二、SARS冠状病毒的理化性质405

三、SARS冠状病毒的基因组结构406

四、SARS冠状病毒基因组编码蛋白及其功能407

第五节 SARS冠状病毒的增殖和变异408

一、SARS冠状病毒受体408

二、SARS冠状病毒的增殖409

三、SARS冠状病毒的变异410

第六节 SARS冠状病毒的致病机制410

一、SARS冠状病毒的流行病学特点410

二、SARS冠状病毒的发病机制411

第七节 SARS冠状病毒的预防和治疗原则411

一、SARS冠状病毒的预防原则411

二、SARS冠状病毒的治疗原则412

第八节 展望412

第二十三章 分子病毒学实验方法414

第一节 细胞培养414

一、细胞培养的分类414

二、细胞培养的基本条件414

三、细胞培养的方法415

第二节 病毒的扩增与复制415

一、PCR在病毒学领域的用途416

二、PCR的基本原理416

三、PCR步骤的要点416

四、PCR的影响因素416

五、几种特殊PCR技术和其他扩增技术417

第三节 病毒的分离与鉴定419

一、标本的采集与送检419

二、病毒的分离419

三、分离病毒的鉴定420

第四节 病毒效价测定421

一、病毒核酸效价检测421

二、病毒抗原效价检测421

三、病毒特异性抗体的效价检测422

第五节 病毒的动物模型422

一、RNA病毒敏感动物423

二、DNA病毒敏感动物425

三、其他病毒的敏感动物425

第六节 病毒的结构分析425

一、病毒核酸的分析425

二、病毒蛋白的分析426

第七节 病毒基因表达调控分析427

一、染色质基因活化的研究方法427

二、转录水平的研究方法427

三、反式作用因子相互作用的检测428

四、研究上游顺式作用元件的方法428

五、转基因与基因敲除技术428

第八节 杂交病毒的方法428

一、核酸探针的分类428

二、几种常见的杂交技术429

附录1 主要参考文献430

附录2 国内外病毒学期刊431

附录3 病毒学研究相关网站432

附录4 关键词433