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第一章 计算机基础1

1.1 操作系统1

1.1.1 DOS1

1.1.2 UNIX7

1.1.3 Windows12

1.2 计算机语言与程序设计12

1.2.1 计算机语言12

1.2.2 Matlab语言简介14

1.2.3程序设计16

上机训练与习题18

第二章 Internet与网络资源19

2.1 引言19

2.2 Internet基本概念20

2.2.1 计算机网络和TCP/IP协议20

2.2.2 Internet网际地址22

2.2.3 域名系统(DNS)23

2.2.4 连入Internet26

2.3 远程登录28

2.4 文件传输30

2.4.1 FTP的基本用法30

2.4.2 匿名FTP的使用32

2.5 电子邮件(e-mail)33

2.5.1 e-mail的构成33

2.5.2 e-mail的收发软件35

2.5.3 Eudora简介38

2.6 网络新闻与通信讨论组40

2.6.1 电子布告板系统(BBS)40

2.6.2 Usenet网络新闻41

2.6.3 通信讨论组42

2.7 Gopher与WWW服务43

2.7.1 Gopher服务43

2.7.2 WWW简介45

2.7.3 WWW流览器47

2.8 Internet查询工具49

2.8.1 FTP服务器的查询——archie49

2.8.2 用户与计算机节点的查询51

2.8.3 WWW资源的查询52

2.9 服务器的建立与主页制作53

2.9.1 服务器的建立53

2.9.2 主页制作语言55

上机训练与习题67

第三章 Internet中的化学信息69

3.1 联机文献检索69

3.1.1 文献检索系统简介69

3.1.2 UnCover系统70

3.1.3 MEDLINE系统73

3.1.4 Web of Science系统75

3.1.5 中文检索系统77

3.2.1 网上图书馆84

3.2 图书、杂志信息84

3.1.6 光盘检索系统84

3.2.2 网上书店86

3.2.3 出版商主页87

3.2.4 网络杂志89

3.3 专利信息90

3.4 数据库资源92

3.4.1 综合性数据库92

3.4.2 化学信息数据库97

3.4.3 网上化学手册107

3.5 通信讨论组110

3.6 商业信息111

3.7 化学机构信息113

3.8 化学信息资源导航114

上机训练与习题119

4.1.2 结构信息的计算机表示121

4.1.1 数字信息的计算机处理121

4.1 化学信息的计算机表示121

第四章 化学信息的计算机管理与应用121

4.1.3 化学信息的可视化125

4.2 化学信息数据库131

4.2.1 数据库系统的构成131

4.2.2 数据模型和数据库的类型132

4.2.3 数据库的存取过程133

4.2.4 化学信息数据库133

4.3 化学人工智能与专家系统137

4.3.1 人工智能137

4.3.2 知识库137

4.3.3 推理方法141

4.3.4 专家系统143

4.4 计算机辅助结构解析144

4.4.1 结构解析系统的构成144

4.4.2 结构解析的工作过程144

4.4.3 结构解析中的有关技术145

4.5 计算机辅助合成设计148

4.5.1 计算机辅助有机合成148

4.5.2 计算机辅助分子设计155

上机训练与习题159

第五章 化学信息的计算机模拟160

5.1 NMR波谱模拟160

5.1.1 质子NMR谱的量子化学模拟160

5.1.2 13C-NMR谱的计算机模拟163

5.2 分子模拟168

5.2.1 分子模拟的基本方法169

5.2.2 分子力学简介170

5.2.3 分子模拟应用举例182

上机训练与习题184

第六章 化学计量学方法185

6.1 引言185

6.2 化学因子分析186

6.2.1 数据矩阵的构成187

6.2.2 因子分析的基本步骤190

6.2.3 常见的因子分析方法191

6.2.4 主成分回归(PCR)203

6.2.5 偏最小二乘法(PLS)206

6.3 人工神经网络208

6.3.1 人工神经网络的基本特征208

6.3.2 人工神经网络的基本模型208

6.3.3 神经元的结构模型210

6.3.4 人工神经网络的学习算法211

6.3.5 人工神经网络的应用214

6.4 遗传算法218

6.4.1 自然进化与遗传算法218

6.4.2 遗传算法的基本过程219

6.4.3 遗传算法的程序实现221

6.4.4 遗传算法的发展225

6.4.5 遗传算法在化学中的应用226

6.5 模拟退火227

6.5.1 固体退火与模拟退火算法228

6.5.2 模拟退火算法的基本过程229

6.5.3 模拟退火算法的冷却进度表231

6.5.4 模拟退火算法的特点与改进233

6.5.5 模拟退火算法的应用233

6.6 免疫算法234

6.6.1 免疫算法的原理234

6.6.2 一种用于重叠信号解析的免疫算法235

6.7 小波分析239

6.7.1 傅里叶变换239

6.7.2 小波及小波变换241

6.7.3 多尺度信号分解243

6.7.4 小波分析的应用246

上机训练与习题249

主要参考文献251